Перенос ДНК
Известно более 65 видов прокариот, изначально способных к генетической трансформации: умении переносить ДНК из одной клетки в другую, с последующим включением ДНК донора в хромосому клетки реципиента. Некоторые экстремофилы способны осуществлять видоспецифический перенос ДНК, как описано ниже. Тем не менее, пока не ясно, часто ли такие возможности встречаются среди экстремофилов.
Бактерия Deinococcus radiodurans один из самых известных радиорезистентных организмов. Эта бактерия также переносит холод, обезвоживание, вакуум и кислоту и поэтому является полиэкстремофилом. D. radiodurans способна производить генетическую трансформацию. Клетки реципиента могут восстанавливать повреждения ДНК в трансформирующей ДНК донора, вызванные УФ излучением, так же эффективно, как они восстанавливают клеточную ДНК, когда сами клетки облучаются.
Крайне термофильные бактерии Thermus thermophilus и другие родственные виды Thermus способны к генетической трансформации. Halobacterium volcanii, крайне галофильный архей, также способен к естественной генетической трансформации. Между клетками образуются цитоплазматические мостики, которые используются для переноса ДНК от одной клетки к другой в любом направлении.
Sulfolobus solfataricus и Sulfolobus acidocaldarius являются гипертермофильными археями. Воздействие на эти организмы ДНК-повреждающих агентов: УФ излучения, блеомицина или митомицина С, вызывает видоспецифическую клеточную агрегацию. Клеточная агрегация С. acidocaldarius, вызванная ультрафиолетом, посредничает в обмене хромосомного маркера с высокой частотой. Скорость рекомбинации на три порядка выше чем у не индуцированных культур. Frols и др. и Ajon и др. предположили, что клеточная агрегации улучшает видоспецифичный перенос ДНК между клетками Sulfolobus, для восстановления поврежденной ДНК с помощью гомологичной рекомбинации. Van Wolferen и др. отметили, что этот процесс обмена ДНК может иметь решающее значение в условиях повреждающих ДНК, таких как высокие температуры. Он также предположил, что перенос ДНК в Sulfolobus может быть ранней формой сексуального взаимодействия, схожей с более хорошо изученными системами бактериальной трансформации, которые включают видоспецифический перенос ДНК, приводящий к гомологичной рекомбинационной репарации повреждений ДНК (смотреть Трансформация (генетика)).
Внеклеточные мембранные везикулы могут быть вовлечены в передачу ДНК между различными видами гипертермофильных археев. Было показано, что плазмиды, как и вирусный геном могут быть переданы посредством мембранных везикул. В особенности, был зарегистрирован горизонтальный перенос плазмид между гипертермофильными Thermococcus и Methanocaldococcus видами, соответственно принадлежащими к отрядам Thermococcales и Methanococcales.
Классификация
Во всём мире насчитывается много классов экстремофилов, каждый из которых соответствует тому, как его экологическая ниша отличается от мезофильных условий. Эти классификации не являются взаимоисключающими. Многие экстремофилы подпадают под несколько категорий сразу и называются полиэкстремофилами. Например, организмы, живущие внутри горячих скал глубоко под поверхностью Земли являются термофильными и барофильными, подобно Thermococcus barophilus. Полиэкстремофил, обитающий на вершине горы в пустыне Атакама может оказаться радиоустойчивым ксерофилом, психрофилом и олиготрофным организмом. Полиэкстремофилы хорошо известны своей способностью переносить как высокие, так и низкие уровни рН.
Термины
Ацидофил — организм с оптимальным ростом при уровнях рН 3 или ниже.
Алкалифил — организм с оптимальным ростом при уровнях рН 9 или выше.
Анаэроб — организм, которому не требуется кислород для роста, такой как Spinoloricus Cinzia. Существуют два подвида: факультативные анаэробы и облигатные анаэробы. Факультативные анаэробы могут вынести анаэробные и аэробные условия; однако, облигатный анаэроб погибнет даже в присутствии незначительного количества кислорода.
Криптоэндолит — организм, живущий в микроскопических пространствах внутри скал, таких как поры между зёрен заполнителей; они также могут быть названы эндолитами, термин, который включает в себя организмы, населяющие трещины, водоносные горизонты и разломы, заполненные подземными водами глубоко под поверхностью земли.
Галофил — организм, живущий в соляных растворах с содержанием NaCl 25—30 %.
Гипертермофил — организм, который может развиваться при температурах 80-122 °C, встречается в гидротермальных системах.
Гиполит — организм, живущий под камнями в холодных пустынях.
Капнофил — организм, которому для своей жизнедеятельности требуется углекислый газ в концентрации 10—15 %.
Литоавтотроф — организм (обычно бактерия), чьим единственным источником углерода является двуокись углерода и экзэргоническое неорганическое окисление (хемолитотрофы), подобный Nitrosomonas еurораеа; эти организмы способны получать энергию от восстановленных минеральных соединений, таких как пирит, и принимают активное участие в геохимическом круговороте и выветривании материнской породы, таким образом формируя почву.
Металлотолерантный организм способен выносить высокие уровни растворённых тяжёлых металлов в растворе, таких как медь, кадмий, мышьяк и цинк; примеры включают Ferroplasma Sp., Cupriavidus metallidurans и GFAJ-1.
Олиготроф — организм, способный расти в питательно ограниченных условиях.
Осмофил — организм, способный жить в растворах с чрезвычайно высокой концентрацией осмотически активных веществ и соответственно при высоком осмотическом давлении (например, микроскопические грибки, употребляющие мёд в качестве субстрата).
Пьезофил (также упоминается как барофил) — организм, оптимально живущий при высоких давлениях, которые достигаются глубоко в океане или под землёй; обычны в глубоких недрах земли, а также в океанических впадинах.
Полиэкстремофил (от лат. и др.греч. «любовь ко многим крайностям») является организмом, экстремофильным в более чем одной категории.
Психрофил/криофил — организм, способный на выживание, рост или размножение при температуре 10 °С и ниже в течение длительного периода; распространены в холодных почвах, вечной мерзлоте, полярном льду, холодной морской воде, или на/под альпийским снежным покровом.
Радиорезистентные организмы устойчивы к высоким уровням ионизирующего излучения, наиболее часто к ультрафиолетовому излучению, но в том числе и организмы, способные противостоять ядерному излучению.
Термофил — организм, процветающий при температурах 45-122 °C.
Термоацидофил — сочетание термофила и ацидофила, предпочитает температуру 70-80 °С и рН 2-3.
Ксерофил — организм, который может расти в очень сухих, обезвоженных условиях; почвенные микробы в пустыне Атакама служат примером данному типу.
Домен Археи
Живые организмы подразделяются на три домена и шесть царств. Домены включают:
- археи (Archaea);
- бактерии (Bacteria);
- эукариоты (Eukaryota).
Согласно последним данным, археи подразделяется на следующие основные типы:
- Crenarchaeota;
- Euryarchaeota;
- Nanoarchaeota;
- Korarchaeota;
- Thaumarchaeota.
Crenarchaeota
Crenarchaeota состоит в основном из гипертермофилов и термоацидофилов. Гипертермофильные микроорганизмы живут в чрезвычайно жарких или холодных условиях. Термоацидофилы представляют собой архей, которые обитают в чрезвычайно жарких и кислых средах. Их местообитания имеют рН от 5 до 1. Вы найдете эти организмы в гидротермальных жерлах и горячих источниках.
Примеры Crenarchaeota:
- Sulfolobus acidocaldarius — обнаружен вблизи горячих и кислотных вулканических источников, содержащих серу.
- Pyrolobus fumarii — живут при температуре от 90 до 113 градусов Цельсия.
Euryarchaeota
Euryarchaeota — тип архей, включающий галофилов и метаногенов. Экстремальные галофильные микроорганизмы живут в соленой среде. Эти организмы обитают в соленых озерах или в районах, где испарилась морская вода.
Метаногены нуждаются в свободных от кислорода (анаэробных) условиях, чтобы выжить. Они производят метан как побочный продукт метаболизма. Метаногены распространены в таких местах, как болота, водно-болотные угодья, ледяные озера, сточные воды, кишечники животных и людей.
Примеры Euryarchaeota:
- Halobacterium — насчитывает несколько видов галофильных организмов, которые встречаются в соляных озерах и в условиях сильного засоления.
- Methanococcus — Methanococcus jannaschii считается первым генетически упорядоченным археем. Этот метаноген живет вблизи гидротермальных отверстий.
- Methanococcoides burtonii — эти психофильные (холодолюбивые) метаногены обитают в Антарктиде и способны выдерживать чрезвычайно холодные температуры.
Nanoarchaeota
Nanoarchaeota — тип архей, который был включен в основную классификацию домена с открытием Nanoarchaeum equitans в 2002 году, обнаруженного в гидротермальных источниках у берегов Исландии.
Korarchaeota
Представители типа Korarchaeota считаются очень примитивными живыми микроорганизмами. На сегодняшний день мало известно об основных характеристиках этих архей. Мы знаем, что они термофильные и встречаются в горячих источниках и обсидиановых бассейнах.
Thaumarchaeota
Thaumarchaeota — предложенный в 2008 году тип архей, который на данный момент включает следующие виды: Nitrosopumilus maritimus, Cenarchaeum symbiosum, Nitrososphaera viennensis и Nitrososphaera gargensis. Все представитель этого типа архей принадлежат к хемолитотрофам, окисляющим аммиак.
Цианобактерии Gloeocapsa
Gloeocapsa — род цианобактерий, которые обычно живут на мокрых породах скалистых берегов. Эти бактерии содержат хлорофилл и способны к фотосинтезу. Клетки Gloeocapsa окружены студенистыми оболочками, которые могут быть ярко окрашенными или бесцветными. Ученые обнаружили, что они способны выжить в космосе в течение полутора лет. Образцы горных пород, содержащие Gloeocapsa, были размещены снаружи Международной космической станции, и эти микроорганизмы смогли выдержать экстремальные условия космоса, такие как колебания температур, вакуумное воздействие и радиационное облучение.
Размножение
Археи размножаются бесполым путем: бинарным или множественным делением, фрагментацией или почкованием. Мейоза не происходит, поэтому даже у представителей конкретного вида архей существуют в более чем одной форме, все они имеют одинаковый генетический материал. Клеточное деление определяется клеточным циклом: после того, как хромосома реплицировать и две дочерние хромосомы разошлись, клетка делится. Детали были изучены только для рода Sulfolobus, но особенности его цикла очень схожи с особенностями у эукариот и у бактерий. Репликация хромосом начинается с многих точек начала репликации с помощью ДНК-полимеразы, похожей на аналогичные ферменты эукариот. Однако белки, управляющие клеточным делением, такие как FtsZ, которые формируют сжимающее кольцо вокруг клетки и компоненты септы, проходящей через центр клетки, схожие с их бактериальными эквивалентами.
Археи не образуют споры. Некоторые виды Haloarchaea могут претерпевать изменения фенотипа и существовать как клетки нескольких различных типов, включая толстостенными клетками, устойчивыми к осмотического шока, позволяющие археям выживать в воде с низкой концентрацией соли. Однако эти структуры не служат для размножения, а скорее помогают археям осваивать новые среды обитания.
Астробиология
Область астробиологии связана с теориями возникновения жизни, такими как панспермия, а также затрагивает вопросы о распределении, природе и будущем жизни во Вселенной. В ней экологи-микробиологи, астрономы, планетарные учёные, геохимики, философы и исследователи, конструктивно сотрудничая, направляют свои усилия на поиск жизни на других планетах. Астробиологи особенно заинтересованы в изучении экстремофилов, так как многие организмы данного типа способны выжить в условиях, аналогичных тем, которые как известно, существуют на других планетах. Например, на Марсе могут быть области глубоко под поверхностью вечной мерзлоты, укрывающие сообщества эндолитов. Водный океан под поверхностью Европы, спутника Юпитера, гипотетически может содержать жизнь в глубинных гидротермальных источниках.
Недавние исследования, проведённые над экстремофилами в Японии, состояли из множества бактерий, включая Escherichia coli и Paracoccus denitrificans, которых подвергли условиям экстремальной силы тяжести. Бактерии выращивались в ультрацентрифуге на высоких скоростях, соответствующих 403627 g (то есть в 403627 раз большая сила тяжести, чем на Земле). Paracoccus denitrificans была одной из бактерий, продемонстрировавшей не только выживание, но также устойчивый клеточный рост в условиях сверхускорения, которые обычно можно найти только в космических условиях, например, на очень массивных звёздах или в ударных волнах сверхновых
Анализ показал, что небольшой размер клеток прокариот имеет важное значение для успешного роста при гипергравитации.
26 апреля 2012 года, учёные сообщили, что лишайник выжил и показал замечательные результаты на способность к адаптации фотосинтетической активности в течение 34 дней имитационного моделирования марсианских условий, проведённых в Mars Simulation Laboratory (MSL), Германского центра авиации и космонавтики (DLR).
29 апреля 2013 года, учёные Политехнического Института Ренсселера, спонсируемого НАСА, сообщили, что за время космического полёта на Международную космическую станцию микробы адаптируются к космической среде в «не наблюдаемом на Земле» смысле и таким образом «могут привести к увеличению роста и вирулентности».
19 мая 2014 года, учёные объявили, что многочисленные микроорганизмы, такие как Tersicoccus phoenicis, могут быть устойчивыми к методам, обычно используемым в чистых помещениях для сборки космических аппаратов. На данный момент не известно, могли ли стойкие микробы выдержать космическое путешествие и присутствуют ли они сейчас на Rover Curiosity, планете Марс.
20 августа 2014 года, учёные подтвердили существование микроорганизмов, живущих в полумиле подо льдом Антарктиды.
20 августа 2014 года, российские космонавты сообщили об обнаружении планктона на внешней поверхности иллюминатора Международной космической станции, но затруднились объяснить, как он там оказался.
В феврале 2017 года специалисты Института астробиологии NASA под руководством Пенелопы Бостон обнаружили живые организмы, находящиеся внутри гигантских кристаллов селенита в шахтах под городом Найка мексиканского штата Чиуауа. Они располагаются над магматическим карманом, поэтому температура здесь держится на уровне +60º С. Микроорганизмы находились в кристаллах в течение около 60 тысяч лет в состоянии геолатентности (оставались жизнеспособными), но не проявляли активности. Установлено, что для выживания бактерии, вирусы и археи «использовали» оксид меди, марганец, сульфиды и железо; переработка этих веществ обеспечивала их энергией.
Диссертации
ЗАЩИЩЕННЫЕ ДИССЕРТАЦИИ
| № | Диссертант | Диссертация | Тема работы | Научный руководитель/ консультант | Год защиты |
| 1 | Мирошниченко М.Л. | докторская | Биоразнообразие анаэробных термофильных микроорганизмов морских гидротермальных полей | 2005 | |
| 2 | Слободкин А.И. | докторская | Термофильные железовосстанавливающие прокариоты | Бонч-Осмоловская Е.А. | 2008 |
| 3 | Соколова Т.Г. | докторская | Термофильные гидрогеногенные карбоксидотрофные прокариоты | Бонч-Осмоловская Е.А., Заварзин Г.А. | 2008 |
| 4 | Слободкина Г.Б. | кандидатская | Молекулярная детекция представителей гипертермофильных архей и характеристика архейной термостабильной ДНК-полимеразы | Бонч-Осмоловская Е.А. | 2005 |
| 5 | Прокофьева М.И. | кандидатская | Анаэробные термоацидофильные микробные сообщества | Бонч-Осмоловская Е.А. | 2006 |
| 6 | Перевалова А.А. | кандидатская | Молекулярная детекция и разнообразие Crenarchaeota в наземных горячих источниках | Бонч-Осмоловская Е.А. | 2007 |
| 7 | Гаврилов С.Н. | кандидатская | Физиологические и биохимические механизмы диссимиляционного восстановления Fe(III) термофильной бактерией Carboxydothermus ferrireducens (syn. Thermoterrabacterium ferrireducens) | Слободкин А.И. | 2007 |
| 8 | Кубланов И.В. | кандидатская | Новые анаэробные термофильные прокариоты и их гидролитические ферменты | Бонч-Осмоловская Е.А. | 2007 |
| 9 | Слепова Т.В. | кандидатская | Гидрогеногенные карбоксидотрофные прокариоты в горячих источниках Камчатки | Соколова Т.Г. | 2008 |
| 10 | Козина И.В. | кандидатская | Молекулярная детекция и новые фенотипические свойства термофильных бактерий родов Thermoanaerobacter и Caldanaerobacter | Бонч-Осмоловская Е.А. | 2008 |
| 11 | Непомнящая Я.Н. | кандидатская | Филогенетическое разнообразие микроорганизмов в термофильных железовосстанавливающих сообществах | Нетрусов А.И., Слободкин А.И. | 2010 |
| 12 | Меркель А.Ю. | кандидатская | Молекулярная экология метаногенных и метанотрофных архей гидротермальных мест обитания | Черных Н.А. | 2013 |
| 13 | Подосокорская О.А. | кандидатская | Новые анаэробные целлюлолитические микроорганизмы | Бонч-Осмоловская Е.А. | 2013 |
Микробиом кожи
Кожа человека заселена рядом различных микроорганизмов, которые обитают на поверхности кожи, а также в железах и волосах. Наша кожа находится в постоянном контакте с внешней средой и служит первой линией защиты организма от потенциальных патогенов. Микробиота кожи помогает предотвратить колонизацию кожи патогенами. Она также помогает тренировать нашу иммунную систему, предупреждая иммунные клетки о наличии патогенов и инициируя иммунный ответ.
Экосистема кожи человека очень разнообразная, с различными слоями кожи, уровнями кислотности, температурой, толщиной и воздействием солнечного света. Таким образом, микробы, которые обитают в определенном месте на коже или внутри нее, отличаются от микробов в других частях тела. Например, микроорганизмы, населяющие влажные и горячие части тела (под мышки), отличаются от тех, которые колонизируют сухие, более холодные поверхности кожи на руках и ногах. Комменсальные микроорганизмы, которые обычно населяют нашу кожу, включают бактерий, вирусы, грибы и микроскопических животных, таких как клещи.
Бактерии, колонизирующие кожу, процветают в одном из трех типов кожи: жирной, влажной и сухой. Три основных вида бактерий, населяющих эти типы кожи включают: пропионовокислые бактерии (Propionibacterium) — обнаруженные преимущественно на жирных участках; коринебактерии (Corynebacterium) — обнаруженные во влажных областях; стафилококки (Staphylococcus) — населяющие сухие участки.
Хотя большинство этих видов бактерий не являются опасными, они могут стать вредными для человека при определенных условиях. Например, пропионибактерии акне (Propionibacterium acnes) живут на жирных поверхностях кожи, таких как лицо, шея и спина. Когда организм вырабатывает избыточное количество жира, эти бактерии размножаются с высокой скоростью, что может привести к развитию акне. Другие виды бактерий, например, золотистый стафилококк (Staphylococcus aureus) и стрептококк пиогенес (Streptococcus pyogenes), могут вызывать более серьезные проблемы, такие как септицемия и ангина.
Не так много известно о комменсальных вирусах кожи, поскольку исследования в этой области пока немногочисленны. Было обнаружено, что вирусы находятся на поверхностях кожи, сальных железах и внутри бактерий кожи.
Виды грибков, которые колонизируют кожу человека, включают кандидоз (Candida), малассезия (Malassezia), криптококк (Cryptocoocus), дебариомицес (Debaryomyces) и микроспория (Microsporum). Как и в случае с бактериями, грибки размножаются с необычайно высокой скоростью и могут вызывать проблемные состояния и заболевания. Грибки малассезия способны вызывать перхоть и атопическую экзему.
Микроскопические животные, населяющие кожу, включают клещей. Например, клещи демодекс (Demodex) колонизируют лицо и живут внутри волосяных фолликулов. Они питаются кожным жиром, мертвыми клетками и даже некоторыми бактериями.
Тихоходки
Тихоходки или водные медведи могут переносить несколько типов экстремальных условий. Они живут в горячих источниках, антарктическом льду, а также в глубоких средах, на горных вершинах и даже в тропических лесах. Тихоходки обычно встречаются в лишайниках и мхах. Они питаются растительными клетками и крошечными беспозвоночными, такими как нематоды и коловратки. Водные медведи размножаются половым путем, хотя некоторые размножатся бесполым путем через партеногенез .
Тихоходки могут выживать в различных экстремальных условиях, потому что они способны временно приостанавливать обмен веществ, когда условия не пригодны для выживания. Этот процесс называется криптобиозом и позволяет водным медведям войти в состояние, которое позволит им выжить в условиях экстремальной засушливости, нехватки кислорода, сильного холода, низкого давления и высокой токсичности или радиации. Тихоходки могут оставаться в этом состоянии в течение нескольких лет и выходить из него, когда окружающая среда становится пригодной для жизни.
Паспорта недавно выделенных штаммов
ПАСПОРТА НЕДАВНО ВЫДЕЛЕННЫХ ШТАММОВ
В этом разделе приведены паспорта изолятов прокариот, недавно выделенных и охарактеризованных в соответствии со Стандартными операционными процедурами. Некоторые сведения о штаммах в паспортах, размещенных в открытом доступе, не приведены в связи с охраной РИД.
| № | Краткое описание | Файл |
| 1. | Изолят актинобактерий (Р28-9) из древних мерзлых отложений (глубина 28 — 29 м) нефтегазоконденсатного месторождения Песцовое (п-ов Ямал) | |
| 2. | Изолят актинобактерий (Р28-10) из древних мерзлых отложений (глубина 28 — 29 м) нефтегазоконденсатного месторождения Песцовое (п-ов Ямал) | |
| 3. | Изолят актинобактерий (Р28-11) из древних мерзлых отложений (глубина 28 — 29 м) нефтегазоконденсатного месторождения Песцовое (п-ов Ямал) | |
| 4. | Изолят психротолерантиных актинобактерий (Р28-12) из древних мерзлых отложений ( глубина 28 — 29 м) нефтегазоконденсатного месторождения Песцовое (п-ов Ямал) | |
| 5. | Изолят психротолерантиных актинобактерий (Р28-14) из древних мерзлых отложений (глубина 28 — 29 м) нефтегазоконденсатного месторождения Песцовое (п-ов Ямал) | |
| 6. | Изолят психротолерантиных актинобактерий (Л2-17) из образца повторно-жильного льда плейстоценового возраста обнажения Мамонтова гора (Центральная Якутия) | |
| 7. | Изолят бактерий (3729к) из Мечигменских источников, Чукотка | |
| 8. | Изолят бактерий (3757) из Чаплинских источников, Чукотка | |
| 9. | Изолят азотфиксирующих бактерий из торфяной почвы Дубненского болотного массива, Московская область | |
| 10. | Изолят термофильных метанокисляющих бактерий из гидротермы вулкана Узон, Камчатка, Россия | |
| 11. | Изолят метанотрофных бактерий из почвы с берега оз. Титикак, район г. Пуно, Перу | |
| 12. | Изолят метанотрофных бактерий из органического осадка из садка для рыб, плавучий остров, оз. Титикака в районе г. Пуно, Перу | |
| 13. | Изолят метанотрофных бактерий из донного осадка ручья вблизи р. Амазонка, р-н г. Пуно, Перу | |
| 14. | Изолят метанотрофных бактерий из почвы (на глубине 2 см) в 200 м от берега р. Амазонка, в районе г. Пуно, Перу | |
| 15. | Изолят актинобактерий из нагнетаемой воды Черемуховского нефтяного месторождения, Нурлат, Татарстан | |
| 16. | Изолят бактерий из подземных вод из наблюдательной скважины в районе поверхностного хранилища жидких радиоактивных отходов оз. Карачай, г. Озерск, Челябинская обл. | |
| 17. | Изолят из подземных вод из наблюдательной скважины в районе законсервированного поверхностного хранилища жидких радиоактивных отходов, г. Северск, Томская обл. | |
| 18. | Изолят, выделенный в чистую культуру и являющийся спутником сульфобацилл | |
| 19. | Изолят из жидкой фазы пульпы опытно-промышленной установки для бактериального выщелачивания руды | |
| 20. | Изолят, выделенный в чистую культуру и являющийся спутником ранее описанного микроорганизма | |
| 21. | Изолят бактерий, выделенный в чистую культуру и являющийся спутником ранее описанного микроорганизма | |
| 22. | Изолят бактерий, выделенный в чистую культуру и являющийся спутником умеренно-термофильного нитрификатора | |
| 23. | Изолят бактерий из воды оз. Унтерзее (Антарктида) | |
| 24. | Изолят психротолерантных бактерий из льда скважины с глубины 28м, Мамонтова гора, Сибирь | |
| 25. | Изолят актинобактерий из болотных почв заполярной тундры Аляски | |
| 26. | Изолят актинобактерий из торфяной почвы тундры России, п-ов Ямал | |
| 27. | Изолят галоалкалофильных архей из гиперсоленого озера Кулундинской степи | |
| 28. | Изолят галоалкалофильных архей из гиперсоленого озера Кулундинской степи | |
| 29. | Изолят галоалкалофильных архей из гиперсоленого озера Кулундинской степи | |
| 30. | Изолят галоалкалофильных архей из гиперсоленого озера Кулундинской степи | |
| 31. | Изолят галоалкалофильных архей из гиперсоленого озера Кулундинской степи | |
| 32. | Изолят галонатроно архей из осадков гиперсоленого озера Эльтон |
Микробиом ротовой полости
Микробиом ротовой полости насчитывает миллионы микроорганизмов, существующих, как правило, в взаимовыгодных отношениях с хозяином. В то время как большинство микробов являются полезными, предотвращая ротовую полость от колонизации вредными микроорганизмами, некоторые из них могут становится патогенными при определенных условиях.
Бактерии являются наиболее многочисленными из микроорганизмов ротовой полости и включают стрептококки (Streptococcus), актиномицеты (Actinomyces), лактобактерии (Lactobacterium), стафилококки (Staphylococcus) и пропионибактерии (Propionibacterium). Бактерии защищают себя от стрессовых условий во рту, производя липкое вещество, называемое биопленкой. Биопленка защищает бактерии от антибиотиков, других микроорганизмов, химических веществ, чистки зубов или веществ, опасных для микробов. Биопленки разных видов бактерий образуют зубную бляшку, которая прилипает к поверхностям зубов и может вызвать их разрушение.
Ротовые микробы часто взаимодействуют в интересах друг друга. Например, бактерии и грибки иногда сосуществуют в отношениях, которые могут нанести вред хозяину. Бактерия стрептококк мутанс (Streptococcus mutans) и грибок кандида альбиканс (Candida albicans), работающие в связке, вызывают серьезные проблемы с зубами, чаще всего встречающиеся у дошкольников.
Археи в ротовой полости, включают метаногены Methanobrevibacter oralis и Methanobrevibacter smithii. Протисты, обитающие в полости рта, включают ротовую амёбу (Entamoeba gingivalis) и ротовая трихомонада (Trichomonas lenax). Эти комменсальные микроорганизмы питаются бактериями или пищевыми частицами и встречаются в гораздо большем количестве у людей с заболеванием десен. Ротовые вирусы преимущественно состоят из бактериофагов.
На нашей коже обитает множество микроорганизмов — бактерий и даже микроклещей. Узнав это, вам наверняка захочется поскорее их смыть, но все не так просто: неприятные соседи нам необходимы. «К&З» узнал у эксперта, что такое микробиом кожи, кто на нас живет и что с ними делать.
